L’application FileMaker Pro étant installée sur le disque dur, elle ne charge pas la totalité de la base de données en mémoire vive à l’ouverture du fichier. Au lieu de cela, elle transfère les données requises du disque dur vers la mémoire vive et inversement. Lors de l'utilisation du fichier, des données mises à jour sont écrites sur le disque dur, à partir des tampons de données de la mémoire vive. La principale cause de détérioration des fichiers est imputable à un arrêt inattendu ou à une fermeture inopinée de l'application. En règle générale, une fermeture de session inattendue se produit entre deux mises à jour du fichier sur le disque dur. Dans cette situation, dès l'ouverture suivante de la base de données, FileMaker Pro effectue un contrôle de cohérence du fichier, lequel s'ouvre généralement sans problème. Toutefois, si l’arrêt inattendu se produit au cours d’une mise à jour du disque dur, il peut s’avérer nécessaire de procéder à une
récupération du fichier.